Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms