Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPLO60437 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPLO60437 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPLO60437 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPLO60437 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms