Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAK2O60296 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.4 ms