Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ARHGEF9O43307 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARHGEF9O43307 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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