Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGSM2O43147 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms