Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EBAG9O00559 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms