Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
F8W031 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
F8W031 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
F8W031 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W031 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W031 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W031 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F8W031 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms