Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ISM1B1AKI9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ISM1B1AKI9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms