Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NOTOA8MTQ0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NOTOA8MTQ0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms