Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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