Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX13Q9Y5W8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX13Q9Y5W8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms