Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms