Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms