Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms