Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD3Q9UJU5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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FOXD3Q9UJU5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FOXD3Q9UJU5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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FOXD3Q9UJU5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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FOXD3Q9UJU5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FOXD3Q9UJU5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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