Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGK8

SERGEF, Secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEFQ9UGK8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERGEFQ9UGK8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms