Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM8A1Q9UBU6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM8A1Q9UBU6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms