Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms