Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms