Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC180Q9P1Z9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC180Q9P1Z9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms