Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MIS18AQ9NYP9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms