Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMILIN3Q9NT22 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms