Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRHQ9HD43 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms