Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BCO2Q9BYV7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms