Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-6Q9BXR3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms