Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIOK2Q9BVS4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms