Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
KATNB1Q9BVA0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms