Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf50Q9BV19 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms