Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTA3Q9BTC8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTA3Q9BTC8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTA3Q9BTC8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MTA3Q9BTC8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms