Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms