Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOXF2Q9BQY4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms