Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUSP9Q99956 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP9Q99956 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms