Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms