Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNX1Q96RV3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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