Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms