Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCARF2Q96GP6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms