Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SPTSSAQ969W0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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