Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMARCE1Q969G3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCE1Q969G3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms