Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHMTQ93088 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms