Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GCN1Q92616 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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GCN1Q92616 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
GCN1Q92616 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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GCN1Q92616 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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