Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms