Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DTX3LQ8TDB6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms