Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF548Q8NEK5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF548Q8NEK5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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