Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS2Q86YH6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms