Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP1Q86WV1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms