Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
R3HCC1LQ7Z5L2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
R3HCC1LQ7Z5L2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms