Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LPCAT2Q7L5N7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPCAT2Q7L5N7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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