Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HECW1Q76N89 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms