Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZBED9Q6R2W3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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