Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
UBAP2Q5T6F2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms